民国时期海门的交通以水运为主，同时公路运输逐步兴起。水上运输船只逐渐大型化，据民国35年（1946）统计，全县有货运船116艘，总载重量938吨，其中载重量在10吨以上的货船有32艘，载重量共计626吨，占载重总量的2/3，最大的一艘大型载重船为35吨，可与现在的载重船相比。民国36年（1947），海门有汽车运输公司6家，汽车30辆，其中客运汽车14辆，货运汽车16辆，在省内属领先县份。

水路交通以长江港口为依托，组成内河水路交通网络，主要由“三横五纵”8条航道组成，航道总长280多公里。

“三横”：1.中心河（又称通沙河），是当时海门横贯东西的主要交通命脉，西起通海河（亦称牛洪港竖河、桃源河），经天补、茅镇、三厂、常乐、悦来、三阳、富安镇（今属启东）、通海垦牧公司六堤（今属启东）入黄海，全长约96公里，河宽12米，水深1.8米；2.海界河，这是通、海两地的界河，也是两地共用的交通要道，西起通海河北头，经定心桥、汇源镇、四甲坝、南星镇、中央镇（今属启东）、海复镇（今属启东）、通海垦牧公司五堤（今属启东）入黄海，全长约100公里，河宽14米，水深2米；3.厂河，东起大生三厂，西至茅镇大储栈，全长约10公里，河宽20米，水深1.5米。

“五纵”：1.牛洪港竖河，南起长江口牛洪港，经通海镇（时属南通县，今属通州区）、海神庙、桃源镇至海界河，全长约17公里，河宽10米、水深2米；2.宋季港竖河，南起长江口宋季港，经宋季镇、茅镇、坝头镇、朝阳镇，至海界河，全长21公里，河宽9米，水深1.4米；3.青龙港竖河（又称青四河），南起长江口青龙港，经中心镇、三厂镇、常乐镇、长兴镇至四杨坝（时属南通县），全长14公里，河宽10米，水深1.5米；4.大新港竖河，南起长江口大新港，经汤家镇、麒麟镇至海界河，全长约10公里、河宽约9米、水深约1.4米；5.灵甸港竖河，南起长江口灵甸港，经灵甸镇、悦来镇至海界河，全长约15公里，宽约8米、水深约1.4米。

陆路交通西部以茅镇为中心，中部以三阳镇为中心，东部以海复镇为中心，形成公路网络，主要由“四横九纵”13条公路组成，总里程200多公里。

“四横”：1.南干线，筑于民国9年至14年（1920~1925），是海门修筑的第一条公路，是横贯海门东西全境的重要通道，西自通州入境，经天补、大新、茅镇、三厂、常乐、麒麟、悦来、三阳、和合（今属启东市）、二效（今属启东市）、富兴（今属启东市）、至东兴镇（又称北东兴镇，今属启东市东元镇），全长70公里。2.张洪路（张芝山镇至牛洪港）和兴洪路（大兴至牛洪港）组成海门西部沿江地区的重要通道，全路分段筑成于民国22年（1933），该路由南通县张芝山镇向南入境后向东南，经天星镇（今属通州区）、大安镇（今属通州区）、大成镇（今属通州区）至牛洪港，再由牛洪港向东北至三和镇、大兴镇、至茅镇，全长22公里；3.海界路，是海门中北部地区的重要通道，筑成于民国18年（1929），西起永安桥（海界河与青龙港竖河交界处的海界河上），经长来镇，至凤凰桥（今树勋凤凰桥镇），长11.6公里；4.竖海路，是海门东北部地区的重要通道，筑成于民国18年（1929），西起竖河镇（今属启东市），经中央镇（今属启东市）、至海复镇（今属启东市），长9.3公里。

“九纵”：1.吕久路，筑于民国10年（1921），由南通县吕四镇入境，经竖河镇（今属启东）、蟠龙镇（今属启东），聚隆镇（今属启东），至启东久隆镇，全长16.6公里；2.东海路，筑于民国10年（1921），由启东东兴镇（又称南东兴镇，今属启东市惠萍镇）向北入境，经海丰镇（今属启东）、利民镇（今属启东）、富兴镇至海复镇（今属启东），海门境内长18公里；3.新麒路，筑于民国13年（1924），由南通县新河镇入境，经麒麟镇、汤家镇、崇海镇，至大新港，全长10.5公里；4.海宋路，筑成于民国14年（1925），经茅镇、张家镇、至宋季港，全长6.9公里；5.茅朝路，筑于民国19年（1930），经茅镇、坝头镇、至朝阳镇，全长11.5公里；6.定海路，筑于民国19年（1930），北起定兴桥，经八字桥、连元镇接茅朝路至海门，全长9.4公里；7.青四路，筑成于民国19年（1930），南起青龙港，经中心镇、三厂镇、常乐镇、长兴镇、永安桥出境至南通县四杨坝，长16.3公里；8.灵江路，筑于民国19年（1930），起于灵甸港，经灵甸镇、悦来镇、至江家镇，全长15.8公里；9.久富路，全路分期筑成于民国28年（1939），自启东久隆镇入境，经曹家镇（今属启东）至富兴镇（今属启东），全长9公里。