南通根据地商业经济中，公营商业和合作社商业所占比重相当小，面广量大的是私营商业。私营商业以中小商人经营，坐商虽不少，但行商小贩占绝大多数。领取执照经营的私营商行主要有：粮食行、油行、花生行、猪行、鱼行、蛋行、瓜子行、杂货行、棉纱行、烟丝行等。私营商业者具有多方面的社会关系，经营管理经验丰富，经营方式灵活。充分发挥他们的作用，对于沟通根据地内外物资供销渠道、反对敌人经济封锁、满足军需民用、发展根据地经济，具有十分重大的意义。南通根据地重视私营商业的发展，按照上级政府规定，贯彻执行了扶持和促进私营商业发展的政策，取得了成效。这些政策主要有以下方面：

    1.凡在根据地内开设商店、行、栈的坐商及专业从事贩运的行商，只要守法经营，不论其趸销、零售或经营进出口货物，均受民主政府保护，允许其自由经营，不受侵犯。

    2.一切私营工商业（商店、行、栈）、交通运输（从事客货运输的船只）及供销、生产合作社，均要向政府申请登记。经审查合格，发给营业执照，取得合法经营权利，方可从事经营活动，取缔无证经营。经审查发现贩运或经销政府明令禁止的毒品、赌具、外国化妆品，囤积居奇、哄抬物价，买空卖空、投机倒把等，一概不予发照，并勒令停业。

    3.凡取得合法经营的企业，必须服从政府管理，守法经营。遵守政府对进出口物资管理，凡从根据地贩出农产品，必须换回等值工业品进口，严禁携带伪币进口。

    4.实行合理的税收政策。对私营商业，分别不同情况征收一定的税收。政府奖励贩运军需民用工业品进口。商人运进的中西药品、医疗器械、机电设备、通讯器材、印刷材料、书写纸张、颜色染料、棉纺布匹等，免征或征轻税进口。如政府收购，保证商人实得利润在20%以上。

    5.鼓励城市商人到乡村中多设小店或合作社。允许敌占区的商人进入根据地营业，并保证他们的安全。

    6.鼓励人民开设各类商店。凡有经营能力，但因缺少资本，或经营有困难的，可向政府申请给以贷款扶持。

    7.管理根据地内交通运输事业，以保护商运，调节物资。

    8.在农村中兴设集市，发展农村商业。

    9.代办商业汇款，并签发货币兑换证明书。

    南通根据地认真实施对私营商业的扶持政策。对私营商业的贷款扶持政策得到有效落实。江淮银行、华中银行对城市集镇的小商小贩发放了属于流通领域的小本贷款。1946年9月，通、如、海、启4县共发放小本商业贷款华中币600万元。1948年，为支持商业的恢复，小本贷款指标增加到华中币1亿元。1948年4月，华中银行东南办事处对巴掌镇的26户商家发放商业贷款华中币164万元。得到贷款后的商家，迅速向东南地区设于中心市镇聚星镇的公营大东商店购买红糖、火油、豆油、肥皂，火柴等日用必需品，卖给农民群众。商家在经营中按照“薄利多销”原则，获得合法利润，又为广大农民群众办了事，商业逐步恢复起来，并按规定及时归还银行贷款，使整个社会资金活跃起来，经济运行正常起来。群众普遍反映：共产党的政策真好。1949年2月，华中银行发放的小本商业贷款增加到华中币3亿元。对私营商业的扶持政策全面实施后，为在根据地营业的坐商、行商提供了很大的便利，商人们的人、货安全得到可靠保障，又有利润可图，积极性大大提高，市场呈现繁荣景象。

    但也有少数不法商人非法经营，他们垄断市场，哄抬物价，部分群众深受其害。为了发展正当商业，遏制不法行为，南通根据地政府从三方面采取措施。一是组织商会和同业公会，发挥其团结商人、发展正当贸易、进行对敌斗争、协助政府进行物资统制的重要作用。二是着手改造牙行。牙行是促成买卖成交而收取佣金的中间商。它对促进物资交流有一定的积极作用，但也有操纵价格、垄断市场、从事中间剥削的消极作用。一些牙行佣金过高，且欺行霸市，甚至强迫农民客户成交，农民们十分痛恨。根据地政府对牙行进行改造，规定各种牙行的行佣之最高额，不准超过，同时不准牙行强迫客户投行交易，使客户(主要是农民)有自行交易的自由。同时，加大组织运销合作社的力度，使农民有他们自己的“牙行”——合作社。三是在扶持私营商业发展的同时，也注意限制其消极破坏作用，对不法经营行为，如贩运、经销毒品、赌具；囤积居奇，哄抬物价；买空卖空，投机倒把等，一经发现严格依法惩处。

    小商小贩资本小，周转快，经营灵活。南通根据地积极发挥小商小贩的积极作用，将其视为沟通商品流通、满足军需民用的重要渠道，引导他们做好根据地内有关物资的收购、销售、运输的相关事宜。

    集市贸易是南通根据地商品流通的重要场所。在大、中、小城市被日军占领期间，南通根据地的集市贸易日趋活跃和繁荣。以通东地区为例。20世纪40年代，在通东地区的富安镇附近农村，抗日民主政府组织群众开辟香台庙、王家仓、郁家土地堂农贸市场。每天早晨，每个市场都有三五百人上市，市上设有各类售货摊点三四十个，荤素八鲜、京广杂货、粮食柴草、茶酒肉食、医药用品、铁器、布匹等，五花八门，琳琅满目。市场服务良好，买卖公平，童叟无欺，秩序井然，当地百姓亲切地称之为“朝天镇”。遇到日伪军扰乱，商人们肩挑车推随即撤走。抗日战争胜利后，香台庙、王家仓两处市场自动解散，土地堂市场至新中国成立初才消失。