【区划设置】2020年底，南通市区有崇川区、通州区、海门区和富民港办事处（与南通经济技术开发区管委会合署办公），下辖如东县、启东市、如皋市、海安市。全市有镇65个、街道38个，村民委员会1292个，居民委员会630个，场圃5个。

【区划调整】2020年5月12日，市政府印发《关于变更海安市部分行政区划的批复》：将海安市中城街道更名为海安街道，行政区域不变，办事处驻镇南居委会江海西路86号不变；将海安市南城街道更名为孙庄街道，行政区域不变，办事处驻地由南海居委会迁移到祖师庙村委会,办公地址为祖师庙村委会开元大道188号；将海安市西城街道更名为胡集街道，行政区域不变，办事处驻田庄村委会，办公地点由田庄村开元大道99号迁移到田庄村桥港路6号；将海安市北城街道更名为隆政街道,行政区域不变，办事处驻海北村委会，办公地点由海北村丹凤路205号迁移到海北村丹凤路199号。

2020年7月3日，省政府印发《关于调整南通市部分行政区划的通知》（苏政发〔2020〕60号），南通市行政区划调整为：撤销南通市崇川区、港闸区，设立新的南通市崇川区，以原崇川区、港闸区的行政区域为新的崇川区行政区域，崇川区人民政府驻虹桥街道桃坞路44号；撤销县级海门市，设立南通市海门区，以原海门市的行政区域为海门区行政区域，海门区人民政府驻海门街道北京中路600号。2020年7月28日，市委市政府在南通国际会议中心召开南通市崇川区、海门区揭牌大会，全市各界代表560余人参加。